Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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LMOD1P29536 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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LMOD1P29536 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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LMOD1P29536 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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LMOD1P29536 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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LMOD1P29536 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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LMOD1P29536 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
LMOD1P29536 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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