Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPREP23469 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPREP23469 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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