Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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PTPRBP23467 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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