Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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