Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 DISC1-IT1-201ENST00000456782 762 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LINC01834-201ENST00000567374 385 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC007952.7-201ENST00000583141 757 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AP005230.1-205ENST00000639316 2015 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 VN2R10P-201ENST00000411871 853 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms