Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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