Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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