Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA6DQ8NFY4 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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