Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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