Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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