Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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