Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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TCIRG1Q13488 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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