Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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