Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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