Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RPS29P62273 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPS29P62273 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RPS29P62273 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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