Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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