Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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