Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F8A0AVK6 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F8A0AVK6 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 475.5 ms