Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.9 ms