Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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