Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD40Q6AI12 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms