Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRRQ15256 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms