Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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