Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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