Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PRPF4BQ13523 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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PRPF4BQ13523 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PRPF4BQ13523 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PRPF4BQ13523 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PRPF4BQ13523 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PRPF4BQ13523 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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