Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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