Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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