Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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