Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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