Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRZ1P23471 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms