Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms