Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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