Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FANCB-202ENST00000398334 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRM1-201ENST00000312511 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TRMT112P4-201ENST00000429016 379 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC010967.3-201ENST00000438648 213 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01830-201ENST00000450551 636 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OSBPL10-AS1-207ENST00000455961 411 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KRTAP9-12P-201ENST00000514388 532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC139713.1-201ENST00000515019 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ANKRD39Q53RE8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR7E4P-201ENST00000530317 1013 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MT1E-203ENST00000568293 332 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL121917.2-201ENST00000605044 390 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL391987.5-201ENST00000618472 412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL157371.2-201ENST00000637813 480 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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