Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FSCN1Q16658 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms