Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms