Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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