Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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