Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SP140Q13342 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SP140Q13342 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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