Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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