Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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PTPN13Q12923 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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PTPN13Q12923 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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PTPN13Q12923 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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