Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms