Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTPAP49638 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTPAP49638 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms