Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD12P35452 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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