Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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