Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms