Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXA2O43364 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXA2O43364 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXA2O43364 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXA2O43364 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXA2O43364 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXA2O43364 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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