Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms