Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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