Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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