Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RTL8BQ17RB0 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RTL8BQ17RB0 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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RTL8BQ17RB0 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RTL8BQ17RB0 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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